Bioinformatiker med en baggrund i humanbiologi, molekylærbiologi eller tilsvarende, søges til Klinisk Biokemisk afdeling, Amager Hvidovre Hospital

Er du vores nye bioinformatiker?

Vi søger en erfaren bioinformatiker med molekylærbiologisk eller anden relevant baggrund til vores diagnostiske NGS-sekventering per 1.november eller efter aftale. Vi udfører rutinemæssigt genanalyser for DNA-mutationer i relation til udviklingen af forskellige humane sygdomme især familiære febersyndromer, calcium metaboliske sygdomme og laktoseintolerans. Endvidere udfører vi Non Invasiv Prænatal Testning (NIPT) for Hvidovre Hospitals NIPT-center.

Du vil indgå i en lille molekylærbiologisk sektion på Hvidovre Hospital, hvor du vil være ansvarlig for udvikling, optimering og vedligeholdelse af laboratoriets analysepipelines, statistisk resultatbehandling og håndtering af store datasæt.

Vi forventer, at du har kendskab til brug af forskellige operativsystemer (Linux/Ubunto) og programmeringssprog (Phyton, Bash samt evt. SnakeMake og R). Vi lægger vægt på, at du har indsigt i molekylærgenetik herunder håndtering af data fra NGS-sekventering og gerne med erfaring i variantannotering, klassificering og fortolkning. Kendskab til IGV og GATK til DNA-analyser vil også være en fordel.

Vi lægger vægt på selvstændighed ved løsning af opgaven, men også at du er en imødekommende person med gode pædagogiske evner. Du skal evne at arbejde tværfagligt og kunne bidrage til et godt samarbejde samt arbejdsmiljø. Vi har et tæt samarbejde imellem forskellige faggrupper, og du skal arbejde sammen med læger, molekylærbiologer og bioanalytikere/laboranter.

Vi tilbyder

• Et spændende arbejde i tværfaglige teams med engagerede kollegaer.
• Gode muligheder for udvikling af kompetencer og faglig fordybelse.
• Mulighed for at deltage i forskningsprojekter.
• Uddannelse indenfor Klinisk Biokemi.
• Der er mulighed for enkelte hjemmearbejdsdage med konkrete opgaver.

Dine arbejdsopgaver

• Medansvar for den daglige drift af afdelingens NGS-baserede diagnostik og typningsmetoder i samarbejde med tilknyttede bioanalytikere, laboranter, kliniske akademikere og læger.
• Medansvar for udvikling og vedligehold af NGS-diagnostik i afdelingen.
• Varetage dataanalyse af NGS-sekvenser, fortolkning af fundne DNA-varianter samt svarafgivelse til de kliniske afdelinger.
• Ansvar for optimering og vedligehold af bioinformatisk pipeline.
• Deltage i afdelingens forskning, udvikling og uddannelse.

Der kan sekundært opstå opgaver relateret til afdelingens øvrige områder f.eks. massespektrometri, hvorfor kendskab til datahåndtering af andre omics baserede teknologier, vil være en fordel.

Afdelingen er DANAK akkrediteret efter standard 15.189 og vi lægger vægt på en struktureret og evidensbaseret opgaveløsning med fokus på høj kvalitet.

Om Afdeling for Klinisk Biokemi
 

Klinisk biokemi er en central del af ethvert patientforløb og Klinisk Biokemisk afdeling, Amager  Hvidovre Hospital, varetager analysering af prøver rekvireret fra hospitals- og psykiatriske afdelinger samt fra praksis. Vi havde i år 2022 en produktion på omkring 13,5 mill. analysesvar.

Afdelingen rummer mere end 200 ansatte, herunder 2 overlæger, 1 professor, 4 yngre læger samt 5 kemikere/biokemikere/ingeniører. Afdelingen har en række laboratoriefaciliteter til almen biokemi, hæmatologi, hormonmålinger samt molekylærbiologi.

Du finder yderligere information om afdelingen på:

klinisk-biokemisk-afdeling-AHH

Yderligere oplysninger om stillingen kan fås ved henvendelse til cheflæge Lise Bathum, tlf. 4013 6709, e-mail lise.bathum@regionh.dk  eller molekylærbiolog Louise Ambye, tlf 5091 8130, e-mail  Louise.Ambye@regionh.dk .

Løn- og ansættelsesvilkår i henhold til relevant overenskomst med Danske Regioner.

Ansøgning foregår elektronisk via HR-manager.

Ansøgningsfrist: d. 27.august, 2023.

• Fakta

• Arbejdssted
  Hvidovre Hospital
• Kontaktperson
  Lise Bathum
• Adresse
  Kettegård Allé 30, 2650 Hvidovre
• Stillingstype
  Molekylærbiolog
• Ansættelsesform
  Fast ansættelse
• Ugentlig arbejdstid
  Fuld tid
• Ansættelsens start
  01-11-2023
• Regionens jobnr.
  250714
• Quick-nr.
  451787
• Indrykningsdato
  18-07-2023
• Ansøgningsfrist
  27-08-2023 (udløbet)